W skład Trybunału Obrachunkowego wchodzi 15 członków. Są oni mianowani jednomyślnie przez Radę po konsultacjach z Parlamentem Europejskim na okres sześciu lat. Członkowie wybierają ze swego grona Przewodniczącego na trzyletnią kadencję.
Obowiązki członka Trybunału oraz Przewodniczącego można pełnić przez więcej niż jedną kadencję.
Ustanie członkostwa następuje wskutek śmierci, upływu kadencji, rezygnacji oraz dymisji orzeczonej przez Europejski Trybunał Sprawiedliwości.
Traktat Nicejski wprowadza w zakresie składu Trybunału pewne modyfikacje. Postanowienie, iż w skład Trybunału wchodzi 15 członków, zastępuje postanowieniem, iż w jego skład wchodzi po jednym przedstawicielu z każdego państwa członkowskiego Unii Europejskiej. Liczba członków Trybunału Obrachunkowego będzie ulegać zmianom po akcesji nowych członków do struktur Unii Europejskiej. Zmianie ulegnie także sposób powoływania członków Trybunału – Traktat z Nicei wprowadza zasadę, że będą oni powoływani przez Radę Unii Europejskiej większością kwalifikowaną po konsultacji z Parlamentem Europejskim i po uwzględnieniu wniosków złożonych przez kraje członkowskie.